После кончины царя Федора Алексеевича благодаря проискам Нарышкиных царем был первоначально провозглашен младший царевич Петр, но в результате стрелецкого восстания и затем Земского собора на престоле были утверждены два брата — Иван, в качестве первого царя, и Петр, в качестве второго. Царствование Ивана, по состоянию здоровья, было номинальным: до 1689 года фактически правила царевна Софья, затем Петр I.

Иван Алексеевич женился на Прасковье Федоровне Салтыковой; у них родилось несколько дочерей — Екатерина (будущая герцогиня Мекленбургская), Анна (будущая императрица Анна Иоанновна) и Прасковья.